Le professeur Surbek est né à Bâle et est originaire de Burgdorf dans le canton de Berne. Il a fait ses études de médecine à l'Université de Bâle. Il a accompli sa formation postgraduée pour l'obtention du titre de spécialiste FMH en gynécologie et obstétrique dans divers hôpitaux de Suisse. Il a ensuite été nommé au poste de chef de clinique, puis de médecin-adjoint à la Clinique universitaire de gynécologie et d'obstétrique de Bâle, où il a obtenu son habilitation sur le thème des cellules souches. Il a aussi travaillé et fait de la recherche aux États-Unis et au King’s College Hospital de Londres.

Depuis 2005, il est médecin-chef et professeur ordinaire en gynécologie et obstétrique à la Clinique de gynécologie et obstétrique de l'Inselspital, avec une spécialisation dans le domaine de l'obstétrique et de la médecine fœto-maternelle ainsi qu'en gynécologie et obstétrique opératoire.